Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms