Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nup88Q8CEC0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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