Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trmt6Q8CE96 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms