Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pramef8Q8CE24 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pramef8Q8CE24 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pramef8Q8CE24 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef8Q8CE24 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms