Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrif1Q8CDD9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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