Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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Nhlrc3Q8CCH2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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