Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps147-201ENSMUST00000177028 513 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Lyrm1-207ENSMUST00000208202 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Olfr1332-ps1-201ENSMUST00000119243 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim35Q8C006 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms