Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc2Q8BZW8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms