Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms