Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Snx17Q8BVL3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Snx17Q8BVL3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx17Q8BVL3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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