Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms