Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms