Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrc1Q80VQ1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms