Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms