Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms