Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Eci3Q78JN3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms