Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms