Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssx9Q6XAS3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms