Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd1Q6PIP5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms