Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms