Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pkp4Q68FH0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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