Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kiaa1549Q68FD9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms