Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tpgs2Q66JT5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tpgs2Q66JT5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tpgs2Q66JT5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tpgs2Q66JT5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tpgs2Q66JT5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tpgs2Q66JT5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms