Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctnna3Q65CL1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ctnna3Q65CL1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms