Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms