Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms