Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms