Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms