Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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