Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms