Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms