Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms