Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms