Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Trp53i11Q4QQM4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trp53i11Q4QQM4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trp53i11Q4QQM4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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