Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms