Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Kdm5aQ3UXZ9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms