Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms