Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms