Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Edc4Q3UJB9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edc4Q3UJB9 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms