Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms