Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnrc6cQ3UHC0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms