Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms