Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms