Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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