Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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