Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms