Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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