Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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