Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms