Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Plekhf1Q3TB82 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Plekhf1Q3TB82 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms